You are here

Alata Üreme Kumsalında Bulunan Yeşil Deniz Kaplumbağaları(Chelonia mydas)’nın Mikrosatellit Lokus Analizi

Microsatelite Locus Analysis of Green Turtles (Chelonia mydas) of Alata Beach

Journal Name:

Publication Year:

Keywords (Original Language):

Author NameUniversity of AuthorFaculty of Author
Abstract (2. Language): 
In this study microsatellite loci analysis performed on one ofthe endangered species green sea turtles (Chelonia mydas). Samples collected in 2006 season from Alata beach at the city zone of Mersin. Amplification of CM3 microsatellite locus of 28 non-sibling hatchlings resulted 160–200 bp PCR-DNA fragments which have been sequenced and GT repeat numbers show very high differences between alleles. GT repeat numbers was found between 10– 28 for CM3 locus. Amplification of CM58 microsatellite locus of 30 non-sibling hatchlings, resulted 150 – 165 bp DNA fragments which have GT repeat number between 6 to 15. Amplification of CM72 microsatellite locus of 28 nestling, resulted 250 – 290 bp PCR-DNA fragments which have GT repeats between 9 to 39.
Abstract (Original Language): 
Bu çalışmada dünyada soylarıtehlike altında olan yeşil deniz kaplumbağalarının (Chelonia mydas) genetik özelliklerinin belirlenmesi amacıyla mikrosatellit lokus analizi yapılmıştır. Mikrosatelit lokus için örnekleme Mersin bölgesi Alata kumsalından 2006 üreme sezonu içerisinde farklıyuvalardan yapılmıştır. CM3 mikrosatellit lokusu çoğaltılan 28 yavru birey için 160-200 bç’lik PZR-DNA’larıdizi analizleri sonucu bireylerde GT tekrar sayısının (10-28) alleller arasında oldukça farklılıklar gösterdiği bulunmuştur. CM58 mikrosatellit lokusu çoğaltılan 30 yavru birey için 150-165 bç lik PZR-DNAlar için GT tekrar sayısı6-15 arasında değiştiği; CM72 lokusu için 28 yavru birey 250-290 bç lik PZR-DNA’larda GT tekrar sayısının 9-39 arasında değiştiği saptanmıştır. Genetik çeşitliliğin ortaya çıkartılmasıiçin genomik DNA’da daha çok lokusun incelenmesi gerekmektedir.
247-260

REFERENCES

References: 

Baran, İ. ve Kasperek, M. (1989). Marine Turtles Turkey, Status Survay 1988 and
Recommendation for Conservation and management. WWF, 128.
Baran, İ., Durmuş, H., Çevik, E., Üçüncü, S. ve Canbolat, A.F. (1992). Türkiye Deniz
KaplumbağalarıStok Tespiti. Tr. J. of Zoology, 16, 119-139.
GÜ, Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi, Cilt 31, Sayı1 (2011) 247-260 258
Başoğlu, M. ve Baran, İ. (1982). Anadolu Sahillerinden Toplanan Deniz Kaplumbağası
Materyeli Üzerinde Kısa Bir Rapor. Doğa Bilim Dergisi, Ser. A, 6(2), 69-71.
Bowen, B. W., Meylan, A. B., Ross, J. P.Limpus, C. J. and Balazs G. H.
(1992). Global population structure and natural history of the green sea turtle
(Chelonia mydas) in terms of matriarchal phylogeny.Evolution 46, 865-880.
Ergene Gözükara S., Aymak C. ve Kaska Y. (2003). Alata Kumsalı(Mersin)’nda Deniz
Kaplumbağa (Caretta carettave Chelonia mydas) Populasyonlarının İncelenmesi,
I. Ulusal Deniz KaplumbağalarıSempozyumu, 4-5. Aralık
Encalada , S.E., Lahanas, P.N., Bjorndal, K.A., Bolten, A.B., Miyamoto, M.M.,
Bowen, B.W. (1996). Phylogeography and population structure of the Atlantic
and Mediterranean green turtle Chelonia mydas: a mitochondrial DNA control
region sequence assessment. Mol. Ecol. 5, 473-483.
Fitzsimmons, N. N., Moritz C. and Moore, S. S. (1995) Conservation and dynamics of
microsatellite loci over 300 million years of marine turtle evolution.Mol. Biol.
Evol. 13, 432–440.
Fitzsimmons, N. N., Limpus, C. J., Norman, J. A., Goldizen, A. R. And Miller J. D.
(1997a). Philopatry of male marine turtles inferred from mitochondrial DNA
markers. Proc. Natl. Acad. Sci. USA94, 8912-8917.
Fitzsimmons, N. N., Moritz, C., Limpus, C. J., Pope, L. and Frince, R. (1997b).
Geographic structure of mitochondrial and nuclear gene polymorphisms in
Australian green turtle populations and male-biased gene flow. Genetics 147,1843-1854.
Geldiay, R. (1984). Türkiye’nin Ege ve Akdeniz Kıyılarında Yaşayan Deniz
Kaplumbağalarının (Caretta caretta carettaL. ve Chelonia mydas mydasL.)
Populasyonlarıve Korunmalarıile İlgili Araştırmalar. Doğa Bilim Dergisi,Ser. A
8, 66-75.
Grimaldi, M.-C., ve Crouau-Roy, B. (1997)Microsatellite allelic homoplasy due to
variable flanking sequences.J. Mol. Evol. 44, 336–340.
Hathaway, R.R. (1972). Sea Turtles Unanswered Questions About Sea Turtles in
Turkey.Balık ve Balıkçılı, 20, (1)1-8.
Jarne, P., and Lagoda, P. J. L. Brown, W. M.,M., George, J. and Wilson, A. C. (1996).
Microsatellites, from molecules Rapid evolution to populations and back. Tree, 11,
424–429.
Karl, S. A., B. W. Bowen and J. C. Avise, 1992. Global population genetic structure and
male-mediated gene flow in the green turtle (Chelonia mydas): RFLP analysis of
anonymous nuclear loci. Genetics 131: 163–173.
Kaska, Y. (2000). Genetic structure of mediterranean Sea turtle populations. Tr. Journal
of Zool.,24, 191-197.
GÜ, Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi, Cilt 31, Sayı1 (2011) 247-260 259
Kimura, M. and Ohta, T. (1978). Stepwise mutation model and Genetic divergence
between Atlantic and Indo-Pacific bution of allelic frequencies in a finite
population. Proc. Natl. Acad. Sci. USA,75, 2868–2872.
Lutz, P.L. and Musick, J.A. (1997). The Biology of Sea Turtles, CRC Press, New
York..432pp.
Orti, G., Pearse, D. E. and Avise, J. G.(1997,). Phylogenetic assessment of length
variation at a microsatellite locus. Proc Natl. Acad. Sci. USA, 94, 10745-10749.
Roberts.,M.A., Schwartz T. S., and S.A. Karl. (2004). Global population genetic
structure and Male-mediated gene flow in the green sea turtle Chelonia mydas):
Analysisi of microsatellite loci. Genetics, 166, 1857-1870.
Stephan, W. (1989). Tandem-repetitive noncoding DNA: Forms and DC Forces. Mol.
Biol. Evol., 6, 198–212.
Tautz, D. and Rentz M. (1984). Simple sequences are ubiquitous repetitive components
of eukaryotic genomes. Nucleic Acids Res.17, 4127-4138.
Türkozan, O. (2000). Reproductive Ecology of the Loggerhead Turtle, Caretta caretta,
on Fethiye and Kizilot Beaches, Turkey. Chelonian Conservation and Biology,
3(4), 686-692.

Thank you for copying data from http://www.arastirmax.com