You are here

Home » Content

Enfeksiyöz Hayvan Hastalıklarının Teşhisinde Gerçek Zamanlı (Real-Time) PCR’ın Geleneksel PCR’a göre Avantajları

Advantages of Real-Time PCR than Conventional PCR in Diagnosis of Infectious Animal Disease

Journal Name:

  • Uludag University Journal of The Faculty of Veterinary Medicine

Publication Year:

  • 2013

Key Words:

Keywords (Original Language):

Author NameUniversity of AuthorFaculty of Author
Abstract (2. Language): 
Infectious animal diseases are the most important disease group among all the animal diseases and also have risks for human health. Because of time, practicality, high sensitivity and specificity etc., diagnosis and epidemiologic studies are going on molecular field. Polymerase Chain Reaction (PCR) is most fast-developing molecular method, also basic of lots of molecular methods developed before and/or after PCR and the most wide-using molecular method in diagnosis and epidemiologic studies at the present day. Basis of PCR has dif-ferent systems from past to present and now it is using generally with real-time (RT) systems developed lately. Conventional PCR and its systems are still using in lots of laboratory, but RT technology is developing at tool and kits and is going to up-to-date and common with this evolutions. In this review will be mentioned the ad-vantage of RT PCR than conventional PCR, especially at quality of results, time-saving and advantages at result-cover.
Bookmark/Search this post with
Abstract (Original Language): 
Enfeksiyöz hayvan hastalıkları, hayvan hastalıkları içerisinde en önemli grubu oluşturmakta ve enfeksiyöz hastalıklarının önemli bir bölümü, insan sağlığı için de tehlike arz etmektedir. Zaman kısıtlılığı, pratiklik, sensi-tivite ve spesifite yüksekliği gibi birçok sebeplerle, teşhis ve epidemiyolojik çalışmalar, günümüzde daha çok moleküler yöntemlerle devam ettirilmektedir. Son yıllarda en hızlı gelişim gösteren, kendisinden önce ve sonra geliştirilen birçok moleküler metotun temelini oluşturan, hem teşhis hem de epidemiyolojik çalışmalarda en çok kullanılan moleküler metot, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR)’dır. İlk gelişiminden bu yana birçok temele da-yanılarak çalışılmış olan PCR, son geliştirilen gerçek zamanlı (real-time) sistemlerle, artık daha çok gerçek za-manlı [Real Time (RT)] olarak çalışılmaya devam edilmektedir. PCR’ın ilk şekli olan, geleneksel PCR, birçok laboratuarda kullanılmaya devam etmekte ve sonraları geliştirilen RT PCR teknolojisi de, kullanılan alet ve kitlerde her geçen gün yapılan güncelleştirmelerle, pek çok alanda yaygınlığını artırmaya devam etmektedir. Bu derlemede; geleneksel PCR’a göre birçok yönden avantajlar sağlayan RT PCR’ın özellikle sonuçların; kalitesi, ortaya çıkış süresi ve yorumlamalarına sağladığı avantajlardan bahsedilecektir.
FULL TEXT (PDF): 
PDF icon arastirmax-enfeksiyoz-hayvan-hastaliklarinin-teshisinde-gercek-zamanli-real-time-pcrin-geleneksel-pcra-gore-avantajlari.pdf
  • 2
39
44
  • Turkish

REFERENCES

References: 

1. Ahmad I., Kleven S.H., Glisson J.R., Avakian A.P.,1989. Further studies of Mycoplasma galli-septicum serum plate agglutination antigen growth in medium with artificial liposomes subs-tituting for serum. Avian Diseases, 33, 51-526.
2. Ahmed F.E., 2002. Detection of genetically mo-dified organisms in foods. Trends in Biotechno-logy, 20, 215-223.
3. Akgün Y., 1996. Mikrobiyolojik Tanı Yöntem-leri. Editör: Nuray Serter. Mikrobiyoloji. T.C. Anadolu Üniversitesi Yayınları, No: 490,
43
Açıköğretim fakültesi yayınları, No: 219. Ünite 16, Eskişehir, pp. 259-265.
4. Anonim, 2008. Validation and quality control of polymerase chain reaction methods used for the diagnosis of infectious diseases. Manual of Stan-dards for Diagnostic Tests and Vaccines, Chapter 1.1.5, Ofise International Epizootic terrestrial Manual, Paris.
5. Anonim, 2009. Biotechnology in the diagnosis of infectious diseases and vaccine developments. Manual of Standards for Diagnostic Tests and Vaccines, Chapter 1.1.7. Office International Epizootics Terrestrial Manual, Paris.
6. Arda M., 1995. Biyoteknoloji (bazı temel ilke-ler). Kükem Derneği Bilimsel Yayınları, No: 3, Ankara.
7. Arda M., 2000. Bakteriyal İzolasyon, İdentifi-kasyon. Temel Mikrobiyoloji, 28. Bölüm. Medisan Yayın Serisi, No: 46, genişletilmiş 2. baskı, Medisan Yayınevi, Ankara, pp. 268-272.
8. Avakian A.P., Kleven S.H., Glisson J.R.,1988. Evaluation of the specificity and sensitivity of two commercial enzyme-linked immunosorbent assay kits, the serum plate agglutination test and the hemaglutination-inhibition test for antibodies formed in response to Mycoplasma gallisepticum. Avian Diseases, 32, 262-272.
9. Berry O., Sarre S.D., 2007. Gel-free species identification using melt-curve analysis. Molecu-lar Ecolology Notes, 7, 1-4.
10. Bradbury J.M., McCarthy J.D., Metwalf A.Z.,1990. Microimmunofluorescence for the se-rological diagnosis of avian Mycoplasma infecti-ons. Avian Pathology, 19, 213-222.
11. Bustin S.A., 2000. Absolute quantificatication of m RNA using real-time reverse transcription polymerase chain reaction assays. Journal of Mo-lecular Endocrinology, 25, 169-193.
12. Cockerill F.R., Smith T.F., 2002. Rapid-cycle real-time PCR: A revolution for clinical microbi-ology. American Society for Microbiology News, 68, 77-83.
13. Cockerill F.R., 2003. Application of rapid-cycle real-time polymerase chain reaction for diagnos-tic testing in the clinical microbiology laboratory. Archieves of Pathology and Laboratory Medici-ne, 127, 1112-1120.
14. Ewing M.L., Kleven S.H., Brown M.B., 1996. Comparision of enzyme linked immunosorbent assay and hemaglution inhibition for detection of antibody to Mycoplasma gallisepticum in com-mercial broiler, fair and exhibition and experi-mentally infected birds. Avian Diseases, 40, 13-22.
15. Evans J.D., Thornton D.L., Branton S.L., 2009. Diagnosis of Mycoplasma gallisepticum from broiler breeder flock: comparision of three diag-
nostic methods. İnternational Journal of Poultry Science, 8, 104-107.
16. Gibson U.E., Heid C.A., Williams P.M., 1996. A novel method for real-time quantitative RT-PCR. Genome Research, 6, 995-1001.
17. Güler L., 1995. Konya bölgesinde kanatlıların kronik solunum yolu hastalığı (chronic respira-tory diseases-CRD)’ nin serolojik ve etken izo-lasyonu ile karşılaştırmalı teşhisi üzerine çalışma-lar. Veterinarium, 6, 7-15.
18. Günel T., 2007. Gen anlatımının kantitatif analizi “Real-Time PCR”. Türkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences, 27, 763-767.
19. Gökçelik G., 2008. Mycoplasma infeksiyonları-nın teşhisi ve serolojik izleme programlarının önemi. Veteriner Tavukçuluk Derneği Dergisi, 1, 6-11.
20. Higuchi R., Dollinger G., Walsh P.S., Griffith R., 1992. Simultaneous amplification and detection of specific DNA sequences. Biotechnology, 10, 413–417.
21. Johnson J.R., 2000. Development of polymerase chain reaction-based assays for bacterial gene de-tection. Journal of Microbiological Methods, 41, 201-209.
22. Kahya S., 2009. Tavuklarda Mycoplasma galli-septicum aranması için LightCycler (LC) Poly-merase Chain Reaction (PCR) sisteminin optimi-zasyonu. Uludağ Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Veteriner Mikrobiyoloji Anabilim Da-lı, Doktora Tezi, Bursa.
23. Kubista M., Andrade J.M., Bengtsson M., Foroo-tan A., Jonak J., Lind K., 2006. The real-time polymerase chain reaction. Molecular Aspects in Medicine, 27, 95-125.
24. Klein D., 2002. Quantification using real-time PCR technology: Applications and limitations. Trends in Molecular Medicine, 8, 257-260.
25. Kleven S.H., Yoder H.W., 1984. Mycoplasmosis. Editörler: Purchase H.G., Arp L.H., Domermuth C.H., Pearson J.E. A laboratory manual for the isolation and identification of avian pathogens, 3th edition, American Association of Avian Pat-hologists, Kenet Square, Pennsylvania, pp. 57-62.
26. Kleven S.H., 1975. Antibody response to avian Mycoplasmas. American Journal of Veterinary Research, 36, 563-565.
27. Leutenegger C.M., 2001. The Real-Time Taqman PCR and Applications in Veterinary Medicine. Veterinary Sciences, Tomorrow, 1-15.
28. Mackay I.M., 2004. Real time PCR in the micro-biology laboratory. Clinical Microbiology and Infection, 10, 190-212.
29. Mekkes D.R., Feberwee A., 2005. Real time polymerase chain reaction for qualitative and qu-antitave detection of Mycoplasma gallisepticum. Avian Pathology, 34, 348-354.
44
30. Mhlanga M.M., Malmberg L., 2001. Using Mo-lecular beacons to detect single-nucleotide poly-morphisms with real-time PCR. Methods, 25, 463-471.
31. Raymaekers M., Smets R., Maes B., Cartuyvels R., 2009. Checklist for optimization and validatin of Real-Time PCR assays. Journal of Clinical Laboratory Analysis, 23, 1445-151.
32. Sachse K., 2004. Specifity and performance of PCR detection assays for microbial pathogens. Molecular Biotechnology, 26, 61-79.
33. Saiki K.R., Gelfand H.D., Stoffi S., Scharf J.S., Higuchi R., Horn T.G., 1988. Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermos-table DNA polymerase. Science, 239, 487-491.
34. Schochetman G., Jones K.W., 1998. Polymerase Chain Reaction. Journal of Infectious Diseases, 158, 1154-1157.
35. Snell G.C., Cullen G., 1978. An evaluation of rapid serum agglutination inhibition tests for My-coplasmosis in Turkeys. Brazilian Veterinary Jo-urnal, 138, 198-204.
36. Şahin F., Çiftçi M., Pirim İ., 2000. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR). II. Uygulamalı molekü-ler biyoloji teknikleri kurs notları. Ankara Üni-versitesi Biyoteknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi.
37. Türkaslan J., Salihoğlu H., 1989. Çeşitli besiyer-leri kullanılarak Mycoplasma gallisepticum’un bakteriyolojik yöntemlerle izolasyon ve identifi-kasyonu. Pendik Hayvan Hastalıkları Merkezi Araştırma Enstitüsü Dergisi, 2, 53-59.
38. Walker J., Douan G., 1989. DNA Probes: A new role in diagnostic microbiology. Journal of App-lied Microbiology, 67, 229-230.
39. Walker N.J., 2002. A technique whose time has come. Science, 296, 557-559.
40. Valasek M.A., Repa J.J., 2005. The power of real-time PCR. Advances in Physiology Educa-tion, 29, 151-159.
41. Yoder H.W.,1989. Nonspesific reactions to My-coplasma serum plate antigens induced by inacti-vated poultry disease vaccines. Avian Diseses, 33, 60-68.

Thank you for copying data from http://www.arastirmax.com