Evaluation of Barley Microsatellites for Genetic Studies in Bread Wheat
Journal Name:
- Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Doğa Bilimleri Dergisi
Key Words:
Keywords (Original Language):
| Author Name | University of Author | Faculty of Author |
|---|---|---|
Abstract (2. Language):
Genome related studies have been progressed slowly in most plants due to their
large genome size and complex genome structure. Therefore it is becoming
important to evaluate applicability of results belonging to certain species for other
species that can be genetically linked. In this study, DNA from a bread wheat
variety ‘Gerek-79’, growing in wide area of Turkey, was amplified with 29 barley
microsatellite primers by PCR. Allele sizes of radioactively labeled PCR products
were compared with those obtained with same primers in barley. Based on allele
sizes, microsatellites producing products at similar length for wheat were
determined as HVM15, HVM20, HVM23, HVM26, HVM31, HVM36, HVM40,
HVM44, HVM54 and HVM62. In future studies, level of polymorphism among
different wheat varieties will be determined based on those microsatellites from this
study and possibility of using them for genotyping studies being addressed.
Bookmark/Search this post with
Abstract (Original Language):
Genomik çalışmalar çoğu bitkinin oldukça büyük genoma sahip olmaları ve
kompleks genom yapısı göstermeleri nedeniyle yavaş ilerleme göstermektedir. Bu
nedenle bir bitki türünden elde edilen araştırma sonuçlarının o tür ile genetik ilişkisi
olabilecek bir başka tür üzerinde uygulanabilirliğinin araştırılması önem
kazanmaktadır. Bu araştırmada, Türkiye’de fazla miktarda yetiştirilen bir ekmeklik
buğday çeşidi olan ‘Gerek-79’’un DNA’sı 29 arpa mikrosatelitinin her birine özgü
polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) primerleri kullanılarak çoğaltılmıştır.
Buğdaydan elde edilen radyoaktif PCR ürünleri, daha önce arpada bu primerlerin
kullanılması sonucu elde edilmesi muhtemel ürünlerin alel uzunlukları ile
karşılaştırılmıştır. Alel uzunluklarına göre buğdayda benzer uzunlukta
amplifikasyon ürünleri oluşturan mikrosatelitler HVM15, HVM20, HVM23,
HVM26, HVM31, HVM36, HVM40, HVM44, HVM54 ve HVM62 olarak
saptanmıştır. Bundan sonraki çalışmalarda belirlenen mikrosatelitlerin farklı buğday
çeşitlerindeki polimorfizm özellikleri saptanarak, buğday genotiplendirme
çalışmalarında kullanılma olasılığı incelenecektir.
FULL TEXT (PDF):
- 2